Visual Molecular Dynamics是款功能強(qiáng)大的化學(xué)繪圖和分子運(yùn)動分析工具。它可以為研究人員提供可視化的生物化學(xué)分子的運(yùn)動模擬，提供優(yōu)秀的作圖能力，操作簡單，方便快捷，非常好用。

【使用說明】

　　VMD 是 Visual Molecular Dynamics 的縮寫，是一個分子可視化分析工具，適用于蛋白質(zhì)、核酸、脂雙層，RNA，DNA等的分子動力學(xué)軌跡分析和作圖，同時也支持有機(jī)分子軌道和電子分布的作圖。VMD可以用來查看一般的分子，讀取標(biāo)準(zhǔn)的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫（PDB）文件，并顯示所包含的結(jié)構(gòu)。

【注意事項(xiàng)】

　　VMD 提供了各種渲染和著色分子的方法，包括：簡單的點(diǎn)和線、CPK球體和圓柱體、licorice bonds、backbone tubes and ribbons、卡通繪畫和其他。VMD可用于動畫和分析的分子動力學(xué)（MD）模擬的軌跡，在特殊情況下，可以充當(dāng)外部MD方案作為一個圖形化的前端顯示和遠(yuǎn)程計(jì)算機(jī)上進(jìn)行模擬動畫分子，它使用大型結(jié)構(gòu)的高性能渲染的OpenGL和OpenGL可編程著色語言。